L'Institut écocitoyen est une association dont les missions principales sont l'acquisition de connaissances scientifiques autour des questions sanitaires et environnementales, la transmission de ces savoirs et l’organisation d’actions de surveillance et de protection de l’environnement. Pour la première fois, citoyens, élus, industriels et scientifiques collaborent à un projet commun à l'échelle d'un territoire.
En 2013, l’Institut a conduit une première étude de contamination du milieu marin dans le Golfe de Fos. Des volontaires (pêcheurs professionnels dans le golfe) et des chercheurs ont collaboré pour identifier l’espèce la plus pertinente : le congre. Les résultats ont été précurseurs pour toutes les études sur le milieu marin conduites, par la suite, par l’Institut et ses partenaires.